Roboteine

Le Centre d’ingénierie des protéines (CIP) de l’ULg vient de recevoir une excellente nouvelle : son projet – Roboteine*, en partenariat avec l’ULB – a retenu l’attention de la Région wallonne qui lui octroie un financement de 1,5 million d’euros pour l’achat d’équipements de pointe. « Roboteine est le nom d’une plateforme de clonage, d’expression, de purification et d’analyse de protéines reposant sur des méthodes originales développées par notre laboratoire, explique le Pr André Matagne. Avec cet outil, nous avons l’ambition d’offrir, aux chercheurs et aux entreprises, une technologie de pointe unique en Fédération Wallonie-Bruxelles. »

Déjà équipé d’un robot de pipetage associé à deux spectromètres lecteurs de microplaques, le CIP a voulu amplifier ce dispositif avec des appareils complémentaires, à savoir un repiqueur de colonies pour optimiser l’expression des protéines et deux systèmes d’analyse pour une caractérisation rapide. « Ce qui transformera l’ensemble en une véritable plateforme automatisée de haute technologie », renchérit Alain Brans, 1er attaché de recherche au CIP. Le laboratoire de structure et fonction des membranes biologiques (Pr Erik Goormaghtigh de l’ULB), partenaire du projet et spécialisé dans l’étude par infrarouge des niveaux de structure des protéines, s’équipera pour sa part d’un appareillage spécifique d’analyse à haut débit des structures protéiques.

Des protéines, pourquoi faire ?

Les protéines interviennent dans un grand nombre de processus biologiques et sont utilisées tant dans les domaines de la santé et de l’alimentation que dans celui des nanotechnologies. « Aujourd’hui, on assiste à une petite révolution dans le monde pharmaceutique, note André Matagne. Le nombre de biomédicaments dont la plupart sont des protéines recombinantes est en hausse, ce qui traduit aussi la volonté de privilégier des technologies plus propres pour l’environnement. »

Ce recours à des molécules issues du vivant a notamment permis d’étoffer la gamme des antibiotiques, en particulier celle des pénicillines. « De nouvelles générations de médicaments sont issues de l’ingénierie du vivant. C’est le cas de l’insuline, des anticorps monoclonaux (qui ciblent des mécanismes pathologiques extrêmement précis) et également des vaccins. Nul besoin de préciser que ceux-ci représentent aujourd’hui d’importants enjeux médicaux et économiques », reprend le professeur. De manière générale, les biothérapies multiplient le nombre de molécules disponibles et les nouveautés thérapeutiques.

L’objectif de la plateforme Roboteine est double : permettre des recherches innovantes et aider les industriels à définir leurs stratégies de conception et de production des biomédicaments et d’enzymes. Plusieurs entreprises sont déjà sur les rangs pour bénéficier de la nouvelle infrastructure du CIP : Eurogentec, ProGenosis et Puratos, notamment.

Innovation

Les nouveaux équipements arriveront au début de l’automne. Restera alors à mettre au point les différents protocoles expérimentaux, indispensables à toute recherche. Ce sera, en particulier, le travail de Julie Vandenameele, chercheuse post-doc au CIP. Déjà impliquée dans le projet “Recoins” soutenu par la Région wallonne, elle travaille en collaboration avec l’UNamur à l’amélioration du procédé de repliement des protéines. « L’expertise du CIP en la matière est bien reconnue, résume la chercheuse. Lorsque la plateforme sera opérationnelle, nous pourrons, sur mesure, réaliser des protocoles utiles aux équipes de recherche. »

* Projet interuniversitaire (dans le cadre de Equip 2013) mené avec le laboratoire de structure et fonction des membranes biologiques (ULB) et le laboratoire Structural Biology (VUB). L’implémentation d’une plateforme de product ion et caractérisation de protéines à haut débit s’inscrit dans le cadre défini par le pôle de compétitivité Bio Win.